Pracownia Mikrośrodowiska Nowotworów


Kierownik
Dr hab. Agnieszka Bronisz - tel. 22 60 86 567 Ten adres pocztowy jest chroniony przed spamowaniem. Aby go zobaczyć, konieczne jest włączenie w przeglądarce obsługi JavaScript. ; pokój B-603

Manager ds. projektów/Sekretariat
dr n. biol. Elżbieta Lewandowska-Gnatowska – tel. 22 60 86 502; Ten adres pocztowy jest chroniony przed spamowaniem. Aby go zobaczyć, konieczne jest włączenie w przeglądarce obsługi JavaScript. ; pokój nr B-625

Doktoranci
Mgr Klaudia Kiel - tel. 22 60 86 419 Ten adres pocztowy jest chroniony przed spamowaniem. Aby go zobaczyć, konieczne jest włączenie w przeglądarce obsługi JavaScript.; pokój nr B-610
Mgr Arpita Balakrishnan tel. 22 60 86 419; Ten adres pocztowy jest chroniony przed spamowaniem. Aby go zobaczyć, konieczne jest włączenie w przeglądarce obsługi JavaScript.; pokój nr B-610 

Byli pracownicy i absolwenci
dr Kamil Krawczyński - tel. 22 60 86 419 

Profil badawczy

  • Badanie mikrośrodowiska nowotworów, szczególnie mikrośrodowiska glejaka wielopostaciowego (GBM, ang. Glioblastoma Multifome) oraz komórek GSC (ang. Glioblastoma Stem-like Cell) inicjujących powstawanie tego nowotworu
  • Poznawanie mechanizmów bezpośredniego i pośredniego oddziaływania mikrośrodowiska z  komórkami nowotworowymi
  • Badanie wpływu oddziaływania komórek GSC z mikrośrodowiskiem na mechanizmy molekularne zachodzące w komórce, w szczególności regulację ekspresji genów z udziałem niekodujących RNA (ncRNA) 

Granty

  • Współcelowanie mikrośrodowiska nowwotworu w adaptacji do niedotlenienia uwrażliwia glejaka na immunoterapię wirusem onkolitycznym
    Kierownik projektu: dr hab. Agnieszka Bronisz
    Finansowanie: Narodowe Centrum Nauki, grant Opus 23, nr 2022/45/B/NZ5/04226; 2023 - 2026

  • Rola niekodującego RNA w modyfikacji epigenetycznych mechanizmów nowotworzenia
    Kierownik projektu: dr hab. Agnieszka Bronisz
    Finansowanie: Narodowe Centrum Nauki, grant Opus 15, nr 2018/29/B/NZ1/01016, 2019 - 2023

  • Pęcherzyki zewnątrzkomórkowe modyfikowane ex vivo jako szczepionka przeciwnowotworowa pobudzająca odpowiedź immunologiczną
    Kierownik projektu: mgr Klaudia Kiel
    Finansowanie: Narodowe Centrum Nauki, grant Preludium 20, 2021/41/N/NZ6/02682; 2022 - 2025

  • Pęcherzyki zewnątrzkomórkowe modyfikowane ex vivo jako szczepionka pobudzająca odpowiedź immunologiczną w terapii przeciwnotworowej
    Kierownik projektu: dr hab. Agnieszka Bronisz
    Finansowanie: FBW 001; 2021 - 2022

  • Indukcja śmierci w komórkach glejaka: Regulacja genów związanych z ferroptozą w komórkach macierzystych glejaka jako potencjalna terapia
    Kierownik projektu: dr Kamil Krawczyński
    Finansowanie: FBW 003; 2022 - 2023

Współpraca krajowa

  • Elżbieta Salińska / Instytut Medycyny Doświadczalnej i Klinicznej PAN / Warszawa, Polska

Współpraca zagraniczna

  • E. Antonio Chiocca / Brigham and Women’s Hospital / Boston, MA, USA 
  • Ralph Weissleder / Massachusetts General Hospital / Boston, MA, USA
  • Hiroshi Nakashima / Harvard Medical School / Boston, MA, USA    
  • Franz Ricklefs / Medical Center Hamburg-Eppendorf / Hamburg, Germany 
  • Mariano Viapiano / SUNY Upstate Medical University / Syracuse, NY, USA
  • Bejamin Purow / University of Virginia / Charlottesville, VA, USA

Metody badawcze

  • Proteomika (WB, IF, IHC, spektroskopia masowa)
  • Genomika (qPCR, mikromacierze, NGS)
  • Modele komórkowe (hodowle 3D)
  • Modele zwierzęce (nowotwory wewnątrzczaszkowe)
  • Inżynieria genetyczna (siRNA, shRNA, CRISPR/Cas9, lentiwirusy)
  • Terapeutyczne nośniki (nano-cząsteczki, wirusy onkolityczne, zewnątrzkomórkowe pęcherzyki)

Patenty i zgłoszenia patentowe
US Patent App. 18/031,054 ; 2023; Godlewski J, Bronisz A, EA Chiocca EA Compositions and Methods Targeting circ2082 for the Treatment of Cancer

Wybrane publikacje

  • Kiel K, Król SK, Bronisz A, Godlewski J. MiR-128-3p - a gray eminence of the human central nervous system. Mol Ther Nucleic Acids. 2024 Feb 6;35(1):102141. doi: 10.1016/j.omtn.2024.102141. PMID: 38419943; PMCID: PMC10899074. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/38419943/
  • Szczepaniak A, Bronisz A, Godlewski J. Circular RNAs-New Kids on the Block in Cancer Pathophysiology and Management. Cells. 2023 Feb 8;12(4):552. doi: 10.3390/cells12040552. PMID: 36831219; PMCID: PMC9953808.  https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/36831219/
  • Bronisz A, Rooj AK, Krawczyński K, Peruzzi P, Salińska E, Nakano I, Purow B, Chiocca EA, Godlewski J. The nuclear DICER-circular RNA complex drives the deregulation of the glioblastoma cell microRNAome. Sci Adv. 2020 Dec 16;6(51):eabc0221. PMID:33328224 
  • Godlewski J, Farhath M, Ricklefs FL, Passaro C, Kiel K, Nakashima H, Chiocca EA, Bronisz A. Oncolytic Virus Therapy Alters the Secretome of Targeted Glioblastoma Cells. Cancers (Basel). 2021;13(6):1287. PMID: 33799381
  • Kitamura Y, Kanaya N, Moleirinho S, Du W, Reinshagen C, Attia N, Bronisz A, Revai Lechtich E, Sasaki H, Mora JL, Brastianos PK, Falcone JL, Hofer AM, Franco A, Shah K,. Anti-EGFR VHH-armed death receptor ligand-engineered allogeneic stem cells have therapeutic efficacy in diverse brain metastatic breast cancers. Sci Adv. 2021 Mar 3;7(10):eabe8671.PMID: 33658202;
  • Krawczynski K, Godlewski J, Bronisz A. Oxidative Stress-Part of the Solution or Part of the Problem in the Hypoxic Environment of a Brain Tumor. Antioxidants (Basel). 2020 Aug 14;9(8):747. PMID: 32823815
  • Bronisz A, Salinska E, Chiocca EA, Godlewski J. Hypoxic Roadmap of Glioblastoma-Learning about Directions and Distances in the Brain Tumor Environment. Cancers (Basel). 2020 May 13; 12(5). PMID: 32413951.
  • Ogawa D, Ansari K, Nowicki MO, Salinska E, Bronisz A, Godlewski J. MicroRNA-451 Inhibits Migration of Glioblastoma while Making It More Susceptible to Conventional Therapy. Noncoding RNA. 2019 Mar 15; 5(1). PMID: 30875963.
  • Bhaskaran V, Nowicki MO, Idriss M, Jimenez MA, Lugli G, Hayes JL, Mahmoud AB, Zane RE, Passaro C, Ligon KL, Haas-Kogan D, Bronisz A, Godlewski J, Lawler SE, Chiocca EA, Peruzzi P. The functional synergism of microRNA clustering provides therapeutically relevant epigenetic interference in glioblastoma. Nature Communication. 2019 01 25; 10(1):442. PMID: 30683859.
  • Jun HJ, Appleman VA, Wu HJ, Rose CM, Pineda JJ, Yeo AT, Delcuze B, Lee C, Gyuris A, Zhu H, Woolfenden S, Bronisz A, Nakano I, Chiocca EA, Bronson RT, Ligon KL, Sarkaria JN, Gygi SP, Michor F, Mitchison TJ, Charest A. A PDGFRa-driven mouse model of glioblastoma reveals a stathmin1-mediated mechanism of sensitivity to vinblastine. Nature Communication. 2018 08 06; 9(1):3116. PMID: 30082792.
  • Ricklefs FL, Alayo Q, Krenzlin H, Mahmoud AB, Speranza MC, Nakashima H, Hayes JL, Lee K, Balaj L, Passaro C, Rooj AK, Krasemann S, Carter BS, Chen CC, Steed T, Treiber J, Rodig S, Yang K, Nakano I, Lee H, Weissleder R, Breakefield XO, Godlewski J, Westphal M, Lamszus K, Freeman GJ, Bronisz A, Lawler SE, Chiocca EA. Immune evasion mediated by PD-L1 on glioblastoma-derived extracellular vesicles. Science Advances. 2018 03; 4(3):eaar2766. PMID: 29532035.
  • Rooj AK, Ricklefs F, Mineo M, Nakano I, Chiocca EA, Bronisz A, Godlewski J. MicroRNA-Mediated Dynamic Bidirectional Shift between the Subclasses of Glioblastoma Stem-like Cells. Cell Reports. 2017 06 06; 19(10):2026-2032. PMID: 28591575.
  • Godlewski J, Ferrer-Luna R, Rooj AK, Mineo M, Ricklefs F, Takeda YS, Nowicki MO, Salinska E, Nakano I, Lee H, Weissleder R, Beroukhim R, Chiocca EA, Bronisz A. MicroRNA Signatures and Molecular Subtypes of Glioblastoma: The Role of Extracellular Transfer. Stem Cell Reports. 2017 06 06; 8(6):1497-1505. PMID: 28528698.
  • Mineo M, Ricklefs F, Rooj AK, Lyons SM, Ivanov P, Ansari KI, Nakano I, Chiocca EA, Godlewski J, Bronisz A. The Long Non-coding RNA HIF1A-AS2 Facilitates the Maintenance of Mesenchymal Glioblastoma Stem-like Cells in Hypoxic Niches. Cell Reports. 2016 06 14; 15(11):2500-9. PMID: 27264189.
  • Ricklefs F, Mineo M, Rooj AK, Nakano I, Charest A, Weissleder R, Breakefield XO, Chiocca EA, Godlewski J, Bronisz A. Extracellular Vesicles from High-Grade Glioma Exchange Diverse Pro-oncogenic Signals That Maintain Intratumoral Heterogeneity. Cancer Research. 2016 05 15; 76(10):2876-81. PMID: 27013191.
  • Ansari KI, Ogawa D, Rooj AK, Lawler SE, Krichevsky AM, Johnson MD, Chiocca EA, Bronisz A, Godlewski J. Glucose-based regulation of miR-451/AMPK signaling depends on the OCT1 transcription factor. Cell Reports. 2015 May 12; 11(6):902-909. PMID: 25937278.
  • Godlewski J, Krichevsky AM, Johnson MD, Chiocca EA, Bronisz A. Belonging to a network--microRNAs, extracellular vesicles, and the glioblastoma microenvironment. Neuro-Oncology. 2015 May; 17(5):652-62. PMID: 25301812.
  • Bronisz A, Wang Y, Nowicki MO, Peruzzi P, Ansari K, Ogawa D, Balaj L, De Rienzo G, Mineo M, Nakano I, Ostrowski MC, Hochberg F, Weissleder R, Lawler SE, Chiocca EA, Godlewski J. Extracellular vesicles modulate the glioblastoma microenvironment via a tumor suppression signaling network directed by miR-1. Cancer Research. 2014 Feb 01; 74(3):738-750. PMID: 24310399.
  • Peruzzi P, Bronisz A, Nowicki MO, Wang Y, Ogawa D, Price R, Nakano I, Kwon CH, Hayes J, Lawler SE, Ostrowski MC, Chiocca EA, Godlewski J. MicroRNA-128 coordinately targets Polycomb Repressor Complexes in glioma stem cells. Neuro-Oncology. 2013 Sep; 15(9):1212-24. PMID: 23733246.
  • Bronisz A, Godlewski J, Wallace JA, Merchant AS, Nowicki MO, Mathsyaraja H, Srinivasan R, Trimboli AJ, Martin CK, Li F, Yu L, Fernandez SA, Pécot T, Rosol TJ, Cory S, Hallett M, Park M, Piper MG, Marsh CB, Yee LD, Jimenez RE, Nuovo G, Lawler SE, Chiocca EA, Leone G, Ostrowski MC. Reprogramming of the tumour microenvironment by stromal PTEN-regulated miR-320. Nature Cell Biology. 2011 Dec 18; 14(2):159-67. PMID: 22179046.
  • Godlewski J, Nowicki MO, Bronisz A, Nuovo G, Palatini J, De Lay M, Van Brocklyn J, Ostrowski MC, Chiocca EA, Lawler SE. MicroRNA-451 regulates LKB1/AMPK signaling and allows adaptation to metabolic stress in glioma cells. Molecular Cell. 2010 Mar 12; 37(5):620-32. PMID: 20227367.